Japan Airlines a annoncé une lourde perte en 2005-2006 (47,2 milliards de yens ou 333 millions d'euros), les coûts élevés du pétrole s'ajoutant à une désaffection de ses passagers en raison d'une succession très médiatisée d'incidents de sécurité. Son chiffre d'affaires a augmenté de 3,3 % à 2.199,3 milliards de yens (15,5 milliards d'euros), grâce principalement aux surcharges appliquées sur le prix des billets pour compenser la flambée des prix des carburants.