Le 4 octobre 2023 à Strasbourg, à l'occasion d'un débat sur le pacte asile et migration, Jordan Bardella fustigeait « le détournement de Frontex, empêchée dans son rôle de garde-frontière et cantonnée à celui d'agence d'accueil ». Le Rassemblement national n'est pas le seul parti critique à l'égard de Frontex. Une fronde collective s'était d'ailleurs manifestée le 18 octobre 2022 à Strasbourg : les députés de tous bords exigeaient le gel d'une partie de son budget « jusqu'à ce que des améliorations clés soient apportées ». L'assemblée réclamait le recrutement de vingt officiers et de trois directeurs exécutifs « dotés de qualifications suffisantes » et la mise en place d'un « mécanisme de signalement des incidents graves » aux frontières extérieures. Mais le RN a voté contre.
Jordan Bardella a voté pour la politique agricole commune mais s'est opposé à son financement prévu par le cadre financier pluriannuel (CFP), sur lequel les députés ont pu se prononcer en décembre 2020. Le CFP octroie 387 milliards d'euros à la PAC jusqu'en 2027. « Le RN a voulu priver 450 000 agriculteurs français de l'octroi de 10 milliards d'euros par an », cingle l'élue macroniste Ilana Cicurel.
Quand le Parlement européen a pris la mesure de la crise sanitaire du Covid, à travers des résolutions sur la prévention des pandémies en juillet 2023 ou l'élaboration d'une stratégie pharmaceutique pour l'Europe en novembre 2021, Jordan Bardella a toujours voté contre.
