Emilie Valès
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Le laboratoire Gentyane s'est doté d'un séquenceur ultra rapide qui va permettre d'accélérer les études en vue d'améliorer les variétés de blé ou de tournesol par exemple.
DR Gentyane INRAE
C'est la machine de tous les superlatifs. Quinze fois plus rapide, capable de diviser par trois le coût d'un séquençage, avec une marge d'erreur proche de zéro. Le laboratoire Gentyane, rattaché à l'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) de Clermont-Ferrand (Puy-de-Dôme), s'est doté d'un outil tout simplement « révolutionnaire » selon les ingénieurs.
Le système appelé « Revio » de Pacific Biosciences (PacBio) est un séquenceur capable de décrypter les informations contenues dans de l'ADN de tous les types d'espèces vivantes (humain, animal, végétal, microbe) en un temps record et générant une plus grande quantité de données.
Mais cette machine, extrêmement rare (il n'en existe que deux en France) et sortie en juin dernier, coûte une petite fortune : 800.000 euros. Surtout, sa durée de vie n'est évaluée qu'entre quatre et cinq ans, car les technologies évoluent vite. Elle a été financée grâce au soutien de la Région, dans le cadre du fonds européen de développement régional octroyé par l'Union Européenne.
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Cet investissement onéreux trouve des applications concrètes dans l'agriculture. Car cette machine participe à l'adaptation des cultures et des élevages face au changement climatique. Ce séquenceur permet d'être plus performant dans la sélection génétique de nouvelles variétés. Le laboratoire Gentyane est d'ailleurs impliqué dans le Programme et équipements prioritaires de recherche (PEPR) Agrodiv, piloté par l'Etat et doté de 3,3 millions d'euros de financement. Ce projet doit permettre de caractériser et d'exploiter la diversité génétique ancienne des plantes et des animaux d'intérêt agricole, adaptée au changement climatique et à la transition agroécologique.
Emilie Valès
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