Génomique : la sélection animale à l'heure du big data

Dans le domaine de l'amélioration génétique, l'introduction de la génomique dans les méthodes de sélection animale représente le saut technologique le plus important depuis plus de 40 ans. La sélection génomique permet de prédire le potentiel génétique d'un animal grâce à la lecture de son ADN. Il devient ainsi possible d'évaluer un reproducteur dès son plus jeune âge, sans attendre que sa descendance ait commencé à produire, raccourcissant considérablement les cycles de sélection.

"Il fallait compter entre 7 et 10 ans avant d'avoir des données" rappelle Ludovic Miltgen, responsable de la communication de Gènes Diffusion. Aujourd'hui, pour la plupart des races bovines laitières, la sélection est désormais basée sur des informations génomiques.

"Ce sont les races laitières qui ont le poids économique le plus important, ce sont donc elles qui ont bénéficié les premières des efforts de recherche des sélectionneurs", précise Ludovic Miltgen. Les races à viande, les ovins et les caprins vont à leur tour bénéficier des acquis des avancées génétiques.

Une sélection beaucoup plus rapide

Plus de 200 éleveurs, sélectionneurs européens et 250 bovins sont présents au Simagena, en marge du Salon de l'agriculture. Il faut savoir que 2,5 millions de doses de semence bovine françaises sont commercialisées dans le monde chaque année. L'élevage français offre une large palette génétique avec aussi bien des races hautes productrices que des races bien adaptées aux conditions fourragères et climatiques difficiles. Ce qui explique que sa génétique s'exporte aussi bien. De plus, la très grande taille de ses populations de référence assure une fiabilité des index génomiques. 4 700 bovins ont été génotypés dans le cadre du projet GeMBAL porté entre autres par l'Inra, visant à étendre la sélection génomique aux 18 races bovines laitières et allaitantes en France.

Choisir les qualités des animaux et de leur production

Actuellement, plus de 50 % des inséminations artificielles réalisées dans les élevages français des principales races laitières proviennent de taureaux issus de la sélection génomique. Le progrès génétique est manifeste : les générations les plus jeunes montrent des avantages importants en fertilité, résistance aux mammites et longévité.